学校现设有森林资源与环境、风景园林、木材工业、化学工程、机械电子工程、土木工程、经济管理、人文社会科学、信息科学技术、应用技术、继续教育、南方摄影学院、研究生部和体育教育部等14个院部、39个系。
学校现有3个博士后流动站、25个博士点、3个一级学科博士点、40个硕士点，具有农业推广硕士和工程硕士授予权，并具有硕士、博士学位整体授予权和副教授、教授任职资格的评审权。现有生态学、木材科学与技术、林产化学加工工程和林木遗传育种4个国家级重点学科、1个省级“重中之重”学科和4个省、部级重点学科。
学校现设有52个本科专业，面向全国招生。在校各类学生13000余人，其中研究生1000余人。50年来为国家培养了4万多名建设人才。
学校现有专任教师700余人，其中，中国工程院院士2人，博士生导师60余人，教授80人，副教授300余人。还聘请了包括5位院士在内的60多名兼职教授。学校土地面积6100亩，其中新庄校区占地1300亩，下蜀校区占地4800亩。校舍52万m2，仪器20000台件，8000万元，图书70万册。
学校设有21个研究所、中心，拥有18个江苏省或国家林业局设立的研究开发机构、重点开放实验室和工程中心。改革开放以来，学校每年开展课题研究300多项，共承担各类科研开发项目1500余项，其中包括“973”、“863”在内的国家攻关和部省重点项目580项，国家自然科学基金112项。通过鉴定的科研成果及批准专利390项，有240项获国家、部省以上奖励。其中，国家科技进步一等奖3项、二等奖7项、三等奖19项；国家发明一等奖、三等奖、四等奖各1项，自然科学奖二等奖1项；部、省级奖励207项，中国专利创造发明金奖1项。学校主办《南京林业大学学报(自然科学版、人文社科版)》、《林业科技开发》、《室内设计与装修》和《林业节能》等学术刊物，其中《南京林业大学学报》已成为中国核心期刊。
学校积极开展对外学术交流，与美国、日本、德国等十几个国家的50多所学校及科研机构建立了合作关系。邀请各国学者前来合作研究或访问讲学，并派教师出国留学、进修、考察、合作科研和参加学术会议等，每年招收一定数量的外国留学生和进修生。
目前学校注重依托雄厚的地域经济优势和优越的人文、自然条件，积极探索为经济建设和社会发展服务的有效途径，努力把学校建设成为以生态环境建设和生物资源培育、保护与开发利用为特色，理、工、农、文、管、经等学科协调发展，若干优势领域国际领先，整体实力和办学水平位居国内同类高校前列的教学研究型大学。
